编写Dockerfile

FROM

定制的镜像都是基于FROM镜像的，所以需要找一个基础镜像

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## 基础镜像
FROM pytorch/pytorch:latest
## 维护者信息
LABEL maintainer "MiaoMiaoYang"

RUN

RUN 相当于在容器中执行命令，有以下两种方式

• Shell格式

  1	RUN <命令行命令>

• Exec格式

  1	RUN ["可执行文件","参数1","参数2",...]

注意：Dockerfile的指令每执行一次，都会在docker上新建一层，如果无意义的层过多，会造成镜像膨胀过大。

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FROM centos
RUN yum install wget
RUN wget -O redis.tar.gz "http://download.redis.io/releases/redis-5.0.3.tar.gz"
RUN tar -xvf redis.tar.gz

#### 可简化为以下格式
#### 使用 \  进行换行
#### 使用 && 符号进行连接

FROM centos
RUN yum install wget \
    && wget -O redis.tar.gz "http://download.redis.io/releases/redis-5.0.3.tar.gz" \
    && tar -xvf redis.tar.gz

CMD指令

类似于RUN指令，但是RUN在docker build构建镜像时构建，CMD在docker run时运行

COPY指令

从上下文目录中复制文件或目录到容器里的指定路径

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## [--chown=<user>:<group>]：可选参数，用户改变复制到容器内文件的拥有者和属组。
COPY [--chown=<user>:<group>] <源路径1>...  <目标路径>
COPY [--chown=<user>:<group>] ["<源路径1>",...  "<目标路径>"]

ADD指令

与COPY使用格式一致，不同的是在拷贝tar压缩文件（gzip,bzip2,xz）时，会自动进行复制并解压到目标路径。但是当压缩文件很大的情况下，会导致镜像构建很慢，或者导致崩溃。

ENV指令

设置环境变量

EXPOSE指令

声明端口，在运行时用于随机端口映射

构建Docker镜像

在Dockerfile文件的存放目录下，执行构建动作

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docker build -t [image name]:[image label] .
## example
docker build -t miaomiaoyang/pytorch:test .

最后的.表示本次执行的上下文路径

启动Docker容器

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nvidia-docker run -itd --name nnunet --shm-size 6G -p 8000:80 -p 10022:22 -p 5000:5000 -v /home/MiaoMiaoYang:/MiaoMiaoYang miaomiaoyang/pytorch:test /bin/bash

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docker run --gpus all -itd --name miao --shm-size 15G -p 8000:80 -p 10022:22 -p 5000:5000 -v ~/MiaoMiaoYang:/MiaoMiaoYang miaomiaoyang/pytorch:medical /bin/bash

Pytorch 示例

• Dockerfile

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  FROM pytorch/pytorch:latest ## 维护者信息 LABEL maintainer "MiaoMiaoYang" ARG DEBIAN_FRONTEND=noninteractive ENV TZ=Asia/Shanghai ## 换源，将sources.list/requirements.txt放在 Dockerfile同目录下 ADD sources.list /etc/apt/ ADD requirements.txt /installer/ RUN apt-get update \ && apt-get upgrade --assume-yes \ && apt-get install vim --assume-yes \ ## 添加SSHD服务 && apt-get install openssh-server --assume-yes \ && apt-get install openssh-client --assume-yes \ && echo 'root:123456'|chpasswd \ && mkdir -p /var/run/sshd \ && sed -i 's/PermitRootLogin prohibit-password/PermitRootLogin yes/g' /etc/ssh/sshd_config \ ## pip 添加库 && pip config set global.index-url https://pypi.douban.com/simple/ \ && pip install --no-cache-dir -r /installer/requirements.txt ## 开放端口22，镜像启动时启动SSHD服务 EXPOSE 22 CMD ["/usr/sbin/sshd", "-D"]

ARG DEBIAN_FRONTEND=noninteractive
ENV TZ=Asia/Shanghai

原因是ubuntu 18.04后没有默认的系统时区，装一些包的时候会让我们选择默认时区

• requirement.txt

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  dicom2nifti==2.2.12 imageio==2.9.0 matplotlib==3.3.4 MedPy==0.4.0 natsort==7.1.1 packaging==20.9 pandas==1.2.3 Pillow==8.0.0 pydicom==2.1.2 pyOpenSSL==19.1.0 PyWavelets==1.1.1 PyYAML==5.3.1 scikit-image==0.18.1 scikit-learn==0.24.1 scipy==1.6.1 SimpleITK==2.0.2 six==1.14.0 sklearn==0.0 tqdm==4.46.0 traceback2==1.4.0